赔偿开票通常需要遵循以下步骤进行：
根据赔偿协议或合同，明确赔偿金额。
根据赔偿原因，选择增值税普通发票或增值税专用发票。
准备赔偿方和被赔偿方的名称、纳税人识别号、地址电话、开户行及账号等信息。
在增值税发票管理系统中进行开票操作，录入上述信息，并选择发票代码、发票号码、开票日期等。
开票后，核对发票信息是否准确无误。
将开出的发票打印出来，并加盖财务章和发票专用章。
将打印好的发票交付给被赔偿方。
将开出的发票进行登记存档，以便后续核对和审计。
请注意，赔偿开票必须符合国家税收法律法规，确保发票的真实性和合法性。同时，赔偿方和被赔偿方在签订赔偿协议或合同时应明确赔偿金额和开票要求，以避免后续争议。